Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18533 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18533 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18533 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18533 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms