Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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