Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6P10629 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms