Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LtaP09225 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LtaP09225 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LtaP09225 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LtaP09225 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LtaP09225 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LtaP09225 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LtaP09225 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LtaP09225 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LtaP09225 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LtaP09225 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LtaP09225 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LtaP09225 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LtaP09225 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LtaP09225 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LtaP09225 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LtaP09225 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LtaP09225 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LtaP09225 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LtaP09225 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LtaP09225 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms