Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TtrP07309 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TtrP07309 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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