Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PtprcP06800 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprcP06800 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PtprcP06800 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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PtprcP06800 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprcP06800 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprcP06800 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprcP06800 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms