Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc4a1P04919 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms