Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-Eb1P04230 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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