Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GzmbP04187 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
GzmbP04187 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
GzmbP04187 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms