Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Copb2O55029 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Copb2O55029 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Copb2O55029 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Copb2O55029 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Copb2O55029 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Copb2O55029 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Copb2O55029 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Copb2O55029 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Copb2O55029 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Copb2O55029 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms