Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NudcO35685 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NudcO35685 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NudcO35685 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NudcO35685 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NudcO35685 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NudcO35685 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NudcO35685 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NudcO35685 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NudcO35685 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NudcO35685 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NudcO35685 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NudcO35685 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NudcO35685 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NudcO35685 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NudcO35685 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NudcO35685 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NudcO35685 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NudcO35685 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NudcO35685 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NudcO35685 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NudcO35685 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NudcO35685 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NudcO35685 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NudcO35685 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NudcO35685 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NudcO35685 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NudcO35685 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NudcO35685 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NudcO35685 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NudcO35685 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NudcO35685 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NudcO35685 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NudcO35685 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NudcO35685 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms