Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Dgcr6O35347 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms