Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ebi3O35228 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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