Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kif1cO35071 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms