Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Casq1O09165 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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