Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sec22bO08547 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sec22bO08547 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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