Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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MsmbO08540 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
MsmbO08540 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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