Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3542K7N6U2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms