Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccer2J3QPU5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms