Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm20795J3QP49 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm20795J3QP49 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20795J3QP49 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20795J3QP49 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20795J3QP49 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20795J3QP49 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Gm20795J3QP49 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Gm20795J3QP49 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm20795J3QP49 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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