Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21976J3QNN2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21976J3QNN2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms