Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm17535J3KMR8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gm17535J3KMR8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17535J3KMR8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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