Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Taf4bG5E8Z2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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