Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm5861F6VCN9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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