Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb2E9Q7L1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb2E9Q7L1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms