Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
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Myo5cE9Q1F5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Myo5cE9Q1F5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Myo5cE9Q1F5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Myo5cE9Q1F5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Myo5cE9Q1F5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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