Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gcom1E9PZ54 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms