Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931408C20RikE9PWP9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931408C20RikE9PWP9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms