Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc175E9PVB3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms