Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc8B2RUS7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms