Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otud7bB2RUR8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms