Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nfx1B1AY10 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms