Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-M5A7VMS3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms