Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Samt1A2BED8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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Samt1A2BED8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Samt1A2BED8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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