Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scn3aA2ASI5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn3aA2ASI5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms