Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtcflA2APF3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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