Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramel3A2AHA7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms