Protein–RNA interactions for Protein: A2AD83

Frmd7, FERM domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd7A2AD83 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Frmd7A2AD83 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Frmd7A2AD83 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms