Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pramef6A2A8M8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pramef6A2A8M8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms