Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pabpc1lA2A5N3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1lA2A5N3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms