Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ubl3Q9Z2M6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubl3Q9Z2M6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms