Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn9Q9Z0S7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms