Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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