Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Six6Q9QZ28 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms