Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
VapbQ9QY76 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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