Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr2e3Q9QXZ7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr2e3Q9QXZ7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms