Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Crlf1Q9JM58 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Crlf1Q9JM58 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Crlf1Q9JM58 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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