Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod4Q9JLH8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms