Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL4

Pdzk1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1Q9JIL4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pdzk1Q9JIL4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pdzk1Q9JIL4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms