Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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